Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prim1P20664 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms