Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms