Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ntf3P20181 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms