Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NelfeP19426 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NelfeP19426 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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