Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18530 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18530 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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