Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms