Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PolP11369 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PolP11369 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PolP11369 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PolP11369 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PolP11369 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PolP11369 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms