Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hoxd4P10628 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms