Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01820 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01820 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01820 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01820 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms