Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sp1O89090 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sp1O89090 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms