Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
AurkcO88445 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms