Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp4O70480 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms