Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TsksO54887 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TsksO54887 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TsksO54887 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TsksO54887 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TsksO54887 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TsksO54887 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TsksO54887 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TsksO54887 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TsksO54887 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms