Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms