Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmiO35309 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmiO35309 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NmiO35309 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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NmiO35309 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmiO35309 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NmiO35309 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms