Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2O35245 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Pkd2O35245 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms