Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap23O09044 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap23O09044 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap23O09044 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms