Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3542K7N6U2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms