Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm933J3QPC1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms