Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3336J3QMQ6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3336J3QMQ6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms