Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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