Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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