Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r34G3XA52 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms