Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nccrp1G3X9C2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nccrp1G3X9C2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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