Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp72F8VQC1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms