Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScaperF8VQ70 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms