Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn5F6UCX4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn5F6UCX4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms