Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm28305F6U473 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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