Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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