Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms