Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20521D3Z5F7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20521D3Z5F7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms