Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AU015836B2RUM3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms