Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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