Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm6880A3KG45 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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