Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp8nlA2ABX0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms