Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pramef6A2A8M8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pramef6A2A8M8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pramef6A2A8M8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef6A2A8M8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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