Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms