Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms