Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Snx1Q9WV80 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx1Q9WV80 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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