Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Stub1Q9WUD1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Stub1Q9WUD1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms