Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phtf1Q9QZ09 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phtf1Q9QZ09 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms