Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gpa33Q9JKA5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gpa33Q9JKA5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms