Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tfcp2Q9ERA0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tfcp2Q9ERA0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tfcp2Q9ERA0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tfcp2Q9ERA0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tfcp2Q9ERA0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tfcp2Q9ERA0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tfcp2Q9ERA0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms