Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r46Q9EQ45 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r46Q9EQ45 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r46Q9EQ45 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r46Q9EQ45 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r46Q9EQ45 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r46Q9EQ45 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r46Q9EQ45 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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