Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Csnk1dQ9DC28 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Csnk1dQ9DC28 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms