Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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