Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms