Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms