Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp12Q9D9M2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms