Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbe1Q9D6Y9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms